新疆大學自1978年開始招收研究生，1981年經國務院批準成為首批具有碩士學位授予權的高校，1996年獲得博士學位授予權，2011年實現博士學位授權一級學科零的突破，2021年獲批“資源與環境”工程博士專業學位類別打開了我校培養工程類博士專業學位研究生的嶄新局面。學?，F有2個國家級重點學科，1個國家級重點培育學科；現有3個國家雙一流建設學科、3個自治區“十四五”優勢學科振興工程建設學科，6個自治區“十四五”特色學科創新工程建設學科；14個博士學位授權一級學科、1個工程博士專業學位類別，37個碩士學位授權一級學科，18個碩士專業學位類別，涵蓋了經濟學、法學、文學、歷史學、理學、工學、管理學、哲學等八個學科門類。

截止目前，共培養畢業研究生29700余人，其中博士研究生1200余人，碩士研究生28500余人；現有在校研究生14132人，其中博士研究生1020人，碩士研究生13112人。（數據截止至2023年3月）